Crystal Clear filtermedium består av nyprodusert, rent, knust glass, som bidrar til å få krystallklart vann i bassenget. Crystal Clear leveres i to størrelser, fin- eller grovkornet, og kan brukes i stedet for sand i sandfiltret. For at MagnaPool®- systemet skal fungere tilfredsstillende må det alltid tilsettes Crystal Clear. Crystal Clear med filtrering på 20 μm er mer effektiv enn den sanden som vanligvis brukes i et sandfilter med filtrering på 50 μm. Vannet sirkulerer lettere gjennom glasset og rengjøres dermed raskere. En annen positiv effekt av Crystal Clear er at behovet for tilbakespyling reduseres, noe som kan føre til inntil 75 % sparing av vann, sammenlignet med den tradisjonelle filtreringssubstansen sand. Det kreves 10 % mindre Crystal Clear som filtersubstans i sandfilteret sammenlignet med om det blir brukt sand. Levetiden for Crystal Clear er dessuten hele tre ganger lengre, opp mot cirka 12 år. For optimal filtrering anbefales det at sandfiltertanken fylles med en tredjedel Crystal Clear 1,0–3,0 mm i bunn. Resterende to tredjedeler fylles med Crystal Clear 0,7–1,3 mm. Les mer om dette på side 66-67. Crystal Clear oppfyller standard EN 16713-1.